提要 ·分子动力学简介 ·实验目的 ·预习要求 ·实验原理 ·第一性原理计算的理论基础 ·从头算分子动力学方法(CPMD) ·实验器材 ·实验内容 ·注意事项 ·思考与讨论 实验6-1甲统分子振动光谱的CPMD模拟
提要 • 分子动力学简介 • 实验目的 • 预习要求 • 实验原理 • 第一性原理计算的理论基础 • 从头算分子动力学方法（CPMD） • 实验器材 • 实验内容 • 注意事项 • 思考与讨论 实验6-1 甲烷分子振动光谱的CPMD模拟
预习要求 1.什么是第一性原理？什么是密度泛函理论？ 2.什么是BO绝热近似？ 3.在结构优化之前原子坐标是否需要优化？为什么？ 4. 实验之前需要学习简单的Linux命令（如cd、ls、mkdir、touch等）， CPMD程序的cpmd.x、furiour.x、traj2 atoms.x等命令，以及并行运算 的mpirun命令。 5.学习可视化处理软件VMD、Gnuplot的使用方法。 实验6-1甲统分子振动光谱的CPMD模拟
预习要求 1. 什么是第一性原理？什么是密度泛函理论？ 2. 什么是BO绝热近似？ 3. 在结构优化之前原子坐标是否需要优化？为什么？ 4. 实验之前需要学习简单的Linux命令（如cd、ls、mkdir、touch等）， CPMD程序的cpmd.x、furiour.x、traj2atoms.x等命令，以及并行运算 的mpirun命令。 5. 学习可视化处理软件VMD、Gnuplot的使用方法。 实验6-1 甲烷分子振动光谱的CPMD模拟
提要 ·分子动力学简介 ·实验目的 ·预习要求 ·实验原理 ·第一性原理计算的理论基础 ·从头算分子动力学方法(CPMD) ·实验器材 ·实验内容 ·注意事项 ·思考与讨论 实验6-1甲统分子振动光谱的CPMD模拟
提要 • 分子动力学简介 • 实验目的 • 预习要求 • 实验原理 • 第一性原理计算的理论基础 • 从头算分子动力学方法（CPMD） • 实验器材 • 实验内容 • 注意事项 • 思考与讨论 实验6-1 甲烷分子振动光谱的CPMD模拟
实验原理一一第一性原理计算的理论基础 ·第一性原理计算对离子间的相互作用力处理： 1.离子可以看作经典粒子来处理： 2.系统满足B0绝热近似，即电子的量子行为与离子的经典行为相对独立。 ·对于一个多原子系统，应用BO绝热近似后，就成一个多电子的非均匀电子气，系 统的哈密顿量可以简化为 H=-】 式中等号右边第一项为电子动能，第二项为电子间的势能，第三项为电子与离子间 的相互作用势能。 实验6-1甲统分子振动光谱的CPMD模拟
实验原理——第一性原理计算的理论基础 • 第一性原理计算对离子间的相互作用力处理： 1. 离子可以看作经典粒子来处理； 2. 系统满足BO绝热近似，即电子的量子行为与离子的经典行为相对独立 。 • 对于一个多原子系统，应用BO绝热近似后，就成一个多电子的非均匀电子气，系 统的哈密顿量可以简化为 式中等号右边第一项为电子动能，第二项为电子间的势能，第三项为电子与离子间 的相互作用势能。 实验6-1 甲烷分子振动光谱的CPMD模拟