表观遗传分析技术
表观遗传分析技术
/表观遗传学的研究热点 DNA甲基化 组蛋白共价修饰 染色质重塑 基因组印记 RNA调控 非编码RNA
表观遗传学的研究热点 3 DNA甲基化 组蛋白共价修饰 染色质重塑 基因组印记 RNA调控 非编码RNA
DNA甲基化分析技术 根据研究目的: (1)基因组整体水平甲基化分析 (2)特异位点的DNA甲基化检测 (3)甲基化新位点的寻找 依据对目标DNA预处理将检测技术分为3大类: (1)基于甲基化敏感的限制性内切酶预处理 (2)基于重亚硫酸盐的预处理 (3)基于亲和富集预处理
一、DNA甲基化分析技术 依据对目标DNA预处理将检测技术分为3大类： （1）基于甲基化敏感的限制性内切酶预处理 （2）基于重亚硫酸盐的预处理 （3）基于亲和富集预处理 根据研究目的： （1）基因组整体水平甲基化分析 （2）特异位点的DNA甲基化检测 （3）甲基化新位点的寻找
垂/(一)基因组整体水平甲基化分析 1.甲基化敏感的限制性内切酶法 2.重亚硫酸盐的甲基化分析方法 3.高效液相色谱法(HPLC) 4.高效毛细管电泳法(HPCE 5.变性高效液相色谱法( DHPLO) 6.免疫化学法
（一）基因组整体水平甲基化分析 1. 甲基化敏感的限制性内切酶法 2. 重亚硫酸盐的甲基化分析方法 3. 高效液相色谱法（HPLC） 4. 高效毛细管电泳法（HPCE) 5. 变性高效液相色谱法（DHPLC） 6. 免疫化学法
/1.甲基化敏感的限制性内切酶(MSR法 methy latⅰ on sensitive restriction endonuc ease,MSRE是一类 对其识别位点含有甲基化碱基敏感的限制性内切酶,它们的识别位点中 含有CpG双核苷酸序列,往往只能结合非甲基化的识别序列,而对甲基化 的序列没有结合活性,不能切割。然后经电泳、杂交、PCR等方法检测酶 切结果。可以检测某个基因或DNA序列的甲基化状态,也可用于整个基因 组甲基化状态的筛查。 (1)限制性路标基因组扫描( restriction landmark genome scanning,RLGS) (2)差异性甲基化杂交分析( differential methylation hybridization for methylation analysis, DMH
1. 甲基化敏感的限制性内切酶(MSRE)法 methylation sensitive restriction endonuclease，MSRE是一类 对其识别位点含有甲基化碱基敏感的限制性内切酶，它们的识别位点中 含有CpG双核苷酸序列，往往只能结合非甲基化的识别序列，而对甲基化 的序列没有结合活性，不能切割。然后经电泳、杂交、PCR等方法检测酶 切结果。可以检测某个基因或DNA序列的甲基化状态，也可用于整个基因 组甲基化状态的筛查。 （1）限制性路标基因组扫描（restriction landmark genome scanning, RLGS） （2）差异性甲基化杂交分析（differential methylation hybridization for methylation analysis, DMH ）