I.DNA Microarray DNA microarray results A Novel Inhibitor of the NF-KB Signaling Pathway Encoded by the Parapoxvirus Orf Viru TABLE 1 Summary of NF-KB-regulated gene s de ted by oarray and real-time PCR in primary OFTu cells infected with OV-1A82 or ORFV024 deletion mutant virus OV-IA82A024 mRNA expres: Gene Description GenBank Microa ethOV-LAS20R 4hp.i CCL20 Chemokine ligant 20 NM17426380.02 205.16 CXCL1 Chemokine ligant 1 7M175700 73.72 CXCL2 Chemokine ligant 2 NnM17429969.95 CXCL3 Chemokine ligant3 NM001046513727 12.34 ICAM1 Intercellular adhesion molecule(CD54) 7M174348 3.29 3.29 IL-1a IL-1a NM174092 70.09 1.05 L-6 L-6 7M173923 3.09 8.97 L-8 L-8 NM173925 10.98 11.46 IRF1/LOC789216 IFN regulatory factor 1 7M177432 17.01 1.00 L0C614198 Similar to T-cell activation NF-KB like protein(TA-NF-KB) X0M865597 723 1.00 MAIL Molecule possessing ankyrin repeats induced by LPS 1M17472615.09 2.05 MGC142340 Similar to pentraxin-related protein PTX3 precursor M0010762595.98 752 MMP1 Matrix metallopeptidase 1 (intersticial collagenase) NM1741123.01 4.91 MMP13 Matrix metallopeptidase 13(collagenase 3) NM174398 1.70 2.88 MMP3 Matrix metallopeptidase 3(progelatinase) XM586521 2.08 292 NFKBIA Nuclear factor of kappa light polypeptidase gene enhancer in B-cell inhibitor.alpha NM_0010458689.12 4.40 PTGS2 Prostaglandin-endoperoxidase synthase 2 NM17445 936 3.73 .-a Fold changes are relative to OFTu cells infected the wild-type virus OV-IA82 Fold chan relative to mock-infected OFTu cells and the expression levels on those cells were equal to 1.Values are expressed as calculated based on the mean express P<0.05:t,P<0.01
DNA microarray results I. DNA Microarray
A.LL P.PP.RB.T.UB A.E.1,LP.PD.PP.RB.T.UB A.PP.T LGALS7/LGALS78 GDF15 EGR1 AREG CXCL3 A neurons synthesis of ol phosphate Lo. LPXN 月目月月月月月且豆目员月员司
基因指纹谱的 信号通路注释 可质草 ·血管新 ·ECM ·PI3K-ATK-mTOR 精确治疗的 分子分型 ·PD1PDL1给号通路 ·DNA复制 ·各种代瑞过醒 2份型用药参考 2013年,等人现代谢型线人的基因表达指纹与各种代 A级5照尿避对 信号通路相关,并且显着受数于以5薰尿宠延为基花的化疗订 精吉图卡培他璃 2018年,Yg等人2以在一项二期临床实验中验证了代型胃磨 代谢型 病人显著受益于5-题保运暖+怕美(奥沙6艳或佩铂)化疗,2020 肉沙利的脉的 年1©收重了5氟尿速顺化疗相关的544个肾遮病人数国13列 是过合分发现代谢型人显著受盐于以5飘保为基础 花疗。 2018年,m等人对晚期霄座病人使用PD-1抑剂单药免夜 疗进行7二期临床实同2020年,L发现免型人的 免夜型 销武科尤单抗卡瑞 因表达指纹请与免夜反应,P0tPD-L1信号通路相关,L分析 利珠单杭信迪利单 (m等人的查现西发现免夜型胃高病人显著量结于PD1抑料耐免 抗 陵治疗(图2)。与PDL1CP5表达值或NGS测脚室突变负满 (TMB》对比,用免陵亚型用测胃墙病人的斋说罐解率更有效。 2020年,L发提典型病人的基因表达蚊谱与缩周 B级斯衫南白菌白 DNA复耐增号通路相关,L分析了Oh等人的酸佩刀爱现经提国 经典型 繁衫替多西他喜C 胃造病人显著受益于恒临周期制制(紫衫醇暖多西他答),在另 级曲安蝶单抗 外一组19个映期胃德数城中间,我人使用多西他舞,51,和顺 选行治行,经典型高病人的有效率达到83%。 2020年,L侧发现间质型病人的基因表达指蚊端与血管新生 B绿同帕精尼需 《Angiogenesis)信号通路相关,何帕袖尼,雷夏芦单抗:贝钱 同质性 莫芦单抗贝伐运单 性单抗等瑞物黑于抗由管生成制制010,在15个假罗斯胃高 间质型免疫型经典型代谢型 质人组中。 临数据表明间质病人受益于抗血管生成网制 注:着在药修的证指等极: A级>B级>C>D。所列特仅供参。量蜂治行方案请医
精确治疗的 分子分型
基于抗体捕获的 Match Normal Cancer DNA甲基化检测 Blood Cells Cells DNA Extraction Sonication 甲基化DNA免疫沉淀测序 (MeDIP-seq)2005年 Weberl团队首次开发并使用 5mC 5mC MeDIP-seq在正常和转化的 MeDIP 人类细胞中高效富集甲基化 DNA,产生沉淀甲基化DNA 片段的5-甲基胞苷(5mC,包 括mc和mcG)单克隆抗体 High-throughput 0 Sequencing 利用适合抗体,羟甲基胞嘧 Analysis 啶(hmC)(hMeDIP)和5- 甲酰基胞嘧啶和5-羧基胞嘧 啶也可以通过MeDIP检测。 Normal Cancer Genome Position
基于抗体捕获的 DNA甲基化检测 甲基化DNA免疫沉淀测序 (MeDIP-seq) 2005 年, Weber团队首次开发并使用 MeDIP-seq在正常和转化的 人类细胞中高效富集甲基化 DNA,产生沉淀甲基化DNA 片段的5-甲基胞苷(5mC,包 括mC和 mCG)单克隆抗体 。 利用适合抗体,羟甲基胞嘧 啶(hmC)(hMeDIP)和5- 甲酰基胞嘧啶和5-羧基胞嘧 啶也可以通过MeDIP检测
1,mRNA的转录水平和蛋白质的表达水平不一致 2,直接执行生理功能的是这些基因翻译后的蛋白质,例 如细胞因子
1, mRNA的转录水平和蛋白质的表达水平不一致 2,直接执行生理功能的是这些基因翻译后的蛋白质,例 如细胞因子